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在日本旅游時讓人最為煩惱的就是日本的交通問題。由于語言溝通障礙，許多自由行的朋友也很擔心在交通方面的諸多不便，所以在游玩前在出行上也要花費些功夫。
今天就讓小編來為大家解答日本交通出行上最基本的疑問，以便為有計劃到日本旅游的朋友做基本參考。
交通IC卡
與國內的城市一張IC卡不同的是，東京的交通IC卡有Suica和PASMO兩種卡，但現在在使用上已通用，只是購買的地點會不一樣。購買方式上也比較便利，Suica只要到JR東日本售票機在畫面中選擇Suica購入即可完成購買，而PASMO在地鐵售票機上可以買到，兩種卡的押金均為500日元（約合人民幣29.3元）。不過和國內一樣，IC卡有記名和不記名兩種卡。
IC卡適用范圍：包括東京圈內的JR東日本線路、地鐵、公共汽車以及往返于羽田機場與東京圈之間的東京單軌電車均可使用。除東京地區外，也可在仙臺、新潟地區以及北海道、東海、西日本、九州范圍內的部分地區使用（幾乎全國可用，只有少部分特殊線路和新干線不能使用）。同時在便利商店、的士、自動販賣機、投幣式自動寄存柜等也都可以使用。而如果到關西旅游最常用的則是ICOCA，是JR西日本發行的ICOCA，和Suica一樣用法，但有少部分不能使用。
如果準備返程，卡內余額需要退卡怎么辦？
Suica由于是JR東日本車站所發行的，所以要辦理退卡也只能在東京的JR東日本車站前才能辦理。JR車站設有「みどりの窓口」（綠色窗口）的咨詢室，在那里可以辦理Suica卡的退卡手續，只要和職員說想要退卡就可以了（退卡日語羅馬音：haraimodoshigashitai）。PASMO退款也是相同的道理。
退還金額：余額內先扣除220日元手續費，另加上500日圓押金；如余額小于220日元僅退還押金。
乘坐公共交通出行
不同的公交路線搭乘方式也不一樣，有些是前上后下，而有些是前下后上，所以如果不知道時可排在他人身后觀察。
搭乘上車后先領取整理券，在整理券上可以看到所需車費價格。整理券上面有數字標示，下車前看一下車頭上方的顯示屏，上面會表示要付多少車費。快到站時按下車按鈕準備下車，然后走到司機旁將錢投入收費機內，公交上的收費機帶有找錢功能，所以不用擔心零錢不足。如果已經辦理IC卡，上車時要先刷卡，下車時再次刷卡即可。
在搭乘公交時不要在車內走動，也不用擔心車速太快過站，只要按下下車按鈕都會停下來讓你下車。如果你在車內走動可能會被司機提示讓你坐下，以免發生危險。
在搭乘公共交通時，盡量不要在車內大聲喧嘩和吃東西，以免影響到他人。如果有背背包可將包放到胸前。
出租車的搭乘方式
在車站或是觀光景點附近通常都會有出租車、巴士停車場，因此就會有出租車在排隊等待顧客。
若招不到的時候也可以在路邊尋找空車的出租車，具體出租車會有以下擊中顯示標志：
くうしゃ：即空車，車上沒有客人，可以搭乘。
賃走：車上有客人，請尋找別臺計程車。
支払：車上的客人正在付費中。
回送：司機可能要準備要休息或去加油等。
割增：表示這段時間需要夜間加成費用，通常是晚上10點至第二天5點。
在搭乘時，要以出租車排隊的先后順序上車。
另外特別注意的是，日本出租車的后方車門為自動門，所以不用自己開關車門，司機都會為客人服務。在出租車搭乘處乘車時只需要靠近車門，車門自動打開后就可以直接上車，車門也會自動關閉。
日本出租車主要計價也是跳表的方式。東京出租車起步價從去年1月開始調整為380-410日元(1.052公里)，?超過后將開始跳表，每237m加收80日元。
日本新干線
大部分的日本新干線都有設數個自由席車廂，方便未訂座位的乘客搭乘。但也部分列車全是指定席的列車，因此要事先查好。另外就算持有JR周游券（日本鐵路周游券），也要事先預定并對號入坐。
如果搭乘自由席車廂時，建議提早到站臺等候，以便找到座位。車廂也會分普通車廂和綠色車廂，綠色車廂就類似頭等座位，持JR周游券的話只能搭乘普通車廂。此外，許多JR周游券都有規定可搭乘的新干線車班，有些可持票券免費搭乘自由席。
網絡購票：可在網上預訂新干線以及普通線特快列車的指定席位，可選擇使用信用卡付款或現金付款。
車站購票：新干線的票能在綠色窗口（みどりの窓口）和自動售票機直接購買。到綠色窗口只要事先將坐車的車站、時間以及希望的座位種類出示給服務人員看即可。而自動售票機購票有語言模式可選擇，只要選擇中文后便可依指示購票。
座位種類：
1.綠色座位（＝商務）（グリーン席）
2.指定座位（指定席）
3.自由座位（自由席）
另外，和國內鐵路一樣在新干線上是可以吃東西的，日本許多車站都會推出不同時節的季節限定便當，有些甚至還有特殊造型。因此，搭乘新干線享受鐵路便當也是一項很好的體驗。
新干線大部分列車都配有插座，多設在靠窗或座位前方的椅背上。
從機場到東京市區交通方式
東京有兩大機場：成田機場和羽田機場。成田是國際機場，羽田是內陸機場，但羽田機場較近市區，下機后可以較快到達市區。
兩大機場搭乘交通到達東京方式如下。
羽田機場：1.利木津巴士：單程1230円，到達東京車站最快需35分鐘。
2.東京單軌電車：單程490円，到達“浜松釘”車站約33分鐘。
3.京急線：單程410円，到達品川車站13分鐘。
成田機場：1.京成Skyliner：單程2470円，對號入座。到日暮里最快36分鐘，到上野站41分鐘。
2.成田特快：單程3020円，可到東京、品川、澀谷、新宿、池袋、橫濱、大宮等主要車站，對號入座 到東京最快51分鐘 。
3.公交巴士：有多種選擇，以Tokyo Shuttle京成巴士為例，單程1000円，到東京車站約1小時。
以上就是日本東京公共交通出行篇，希望對你的日本自由行有所幫助。